是的，企业在申请安全生产许可证时需要提交特种作业人员操作资格证书。这是确保企业具备安全生产条件的重要组成部分之一。具体要求包括：

1. 特种作业人员必须经过专门的安全技术培训并考核合格，取得《中华人民共和国特种作业操作证》后，才能上岗作业。
2. 企业需提供特种作业人员的操作资格证明文件，通常包括特种作业人员名单及对应的操作资格证书扫描件。
3. 根据建筑业企业资质标准，企业应按明确要求的种类和数量配备持有有效操作资格证书的特种作业人员。

这些措施旨在确保特种作业的安全执行，防止因无证操作引发的安全事故，并保障施工现场人员的生命财产安全。因此，在准备安全生产许可证申请材料时，企业务必保证所有特种作业人员都具有有效的操作资格证书，并将其作为必要文件提交给审核机关。