在办理工程设计资质的过程中，企业通常需要支付以下几种费用：

1. **资质申请费**：
   - 向主管行政部门（如住房和城乡建设部或其下级地方住建部门）提交资质申请时，会涉及到一定的行政收费。此费用用于覆盖政府部门对资质申请的审核、审批等行政工作成本。具体金额由相关部门规定，可能随政策调整而有所变化，一般会在相关法规文件或申请指南中明确说明。

2. **人员社保费用**：
   - 根据资质标准，企业需要配备一定数量和级别的专业技术人员，并为其缴纳社会保险。在资质申请材料中，通常需要提供技术人员近几个月的社会保险缴费明。这部分费用是企业日常运营中的人力资源成本，而非直接的资质办理费用，但与资质申请密切相关。

3. **专业培训或继续教育费用**：
   - 对于部分需要通过考试或取得注册执业资格的专业技术人员，可能需要参加相关的专业培训或继续教育课程，以满足资质标准要求。这些培训费用由企业提供或由技术人员自行承担，视具体情况而定。

4. **咨询服务费或代理费**：
   - 如果企业选择委托资质咨询服务机构协助办理资质申请，会涉及到咨询服务费或代理费。这类费用涵盖服务机构提供的资料整理、流程指导、疑难解答、材料报送等服务成本。费用高低取决于服务内容、机构定价及市场行情，通常需要双方签订服务协议明确。

5. **其他可能费用**：
   - 在资质申请过程中，还可能产生一些其他费用，如材料制作、打印、邮寄、公、翻译等杂项费用，以及如果需要进行办公场所改造以满足资质要求，可能产生的装修、设备购置等支出。

总的来说，办理工程设计资质过程中确实需要缴纳一系列费用，包括但不限于申请费、人员社保费用、培训费用、咨询服务费以及其他杂项费用。具体金额因地区、资质等级、企业自身情况以及是否委托第三方服务等因素而异。企业在预算和规划资质申请工作时，应充分考虑并预留这些费用，确保整个办理过程的顺利进行。

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