如果初次申请大气污染防治乙级资质未能成功，企业应该采取以下策略进行整改，并为再次申请做好准备：

明确失败原因：

首先，向审批部门请求详细的审查反馈，明确申请失败的具体原因。这可能是人员资质不符、业绩明不足、申请材料错误或缺失、技术装备不达标等。
制定整改计划：

根据反馈，制定针对性的整改计划。比如，如果是因为技术人员资质不足，考虑招聘或符合条件的专业；如果是业绩明不足，整理并补充更详实的项目案例和明材料。
完善申请材料：

仔细复核所有申请材料，确保信息的准确性和完整性。对已有的材料进行修订，补充遗漏的部分，修正错误。
增强技术实力：

投资于技术装备的升级，确保软件系统是最新的且满足行业标准。增加必要的实验室设备或软件工具，提高设计和分析能力。
加强团队培训：

组织专业培训，提升团队成员的专业技能和对资质标准的理解，确保团队整体素质符合资质要求。
优化管理体系：

审视并改进企业内部的质量管理体系、项目管理体系等，确保其有效运行并能提供充分的据支持。
建立沟通机制：

与相关部门保持积极沟通，了解最新的政策动态和要求变化，必要时寻求预审或咨询服务，避免重复错误。
适时再次申请：

在完成所有整改工作后，选择合适的时机重新提交申请。注意不要急于求成，确保所有准备工作充分后再行申请。
持续监督与改进：

即使在再次申请前，也要设立一个持续的监督机制，确保整改措施得到有效执行，并能够及时发现并解决新出现的问题。
通过这些策略，企业可以有效地从初次申请失败中吸取教训，提高再次申请的成功率。在整个过程中，保持耐心和细致，确保每一步都符合资质评审的严格要求。

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